Im Gebiet zwischen der Staatsgrenze zu Österreich und Nuskova ist das Flussbett der Ledava trotz der Eingriffe in der Vergangenheit erhalten geblieben und sind viele Wasserpflanzen sowie hydrologische und morphologische Besonderheiten zu verzeichnen.

Der Ledava-Fluss ist Teil des umfangreichen Habitats des Otters (Lutra lutra) und des Edelkrebses (Astacus astacus).